深圳公司除了基本的申请材料外，办理在线数据处理与交易处理业务（EDI）许可证可能还需要准备以下额外材料：

1.业务模式说明：详细描述公司的业务模式，包括交易流程、数据处理方式等。

2.技术方案：提供与开展EDI业务相适应的技术方案，包括系统架构、安全措施等。

3.数据保护措施：说明公司如何保护用户数据，包括数据加密、访问控制等。

4.交易规则：提供公司的交易规则，包括商品信息管理、订单处理、支付结算等。

5.用户服务体系：描述公司的用户服务体系，包括客服团队、投诉处理机制等。

6.合作伙伴信息：如果有合作伙伴，提供合作伙伴的相关信息，包括合作协议等。

7.业务发展计划：提供公司的业务发展计划，包括市场推广、用户增长等。

需要注意的是，不同地区的通信管理局可能会有不同的要求，具体需要准备哪些额外材料，建议在申请前咨询当地的通信管理局或专业的木准企业代理服务机构（深圳EDI许可证代办电话：18300003210）。